موسسه خیریه حامی یار دارای هیئت مدیره ای مركب از هفت نفر عضو اصلی و دو نفر عضو علی البدل می باشد. امور اجرایی و تصمیم گیری های مختلف در حامی یار با خرد جمعی و دانش گروهی انجام می گیرد. اعضا هیات مدیره داوطلبانی هستند که با دانش و درایت خود موسسه را در رسیدن به یک سازمان متعالی هدایت می کنند. هیئت مدیره براي مدت یک سال انتخاب خواهند شد. انتخاب مجدد اعضاء هیئت مدیره براي دوره هاي بعدي بلامانع است. هیئت مدیره نماینده قانونی موسسه خیریه بوده و وظایف و اختیارات آن در چارچوب اساسنامه به شرح ذیل می باشد.

حفظ و حراست اموال منقول و غیر منقول، رسیدگی به حسابها، پرداخت دیون و وصول مطالبات، تصویب نحوه پرداخت كمک هاي نقدي و غیرنقدي به مددجویان و خانواده هاي ایشان در ارتباط با اهداف موسسه خیریه، اجراي مصوبات مجامع عمومی، افتتاح حساب در بانكها طی انجام تشریفات قانونی، استخدام، عزل، نصب و اخراج کارکنان و تعیین شرایط استخدام و شغل و حقوق آنها، پیشنهاد جهت اصلاح اساسنامه، تنظیم آیین نامه های لازم در خصوص نحوه استفاده از درآمدهای موسسه خیریه و اختصاص بودجه به هریک از اهداف موسسه خیریه، تعقیب جریانات قضائی، اداري و ثبتی در كلیه مراحل قانونی در محاكم، تعیین حكم و تعیین وكیل و عزل آن، قطع و فصل دعاوي از طریق سازش، مصالحه و داوری